排除器質性病變和血液異常等病因，由于神經內分泌系統調節紊亂引起的異常子宮出血，稱為功能失調性子宮出血。由于下丘腦—垂體—卵巢性腺軸功能紊亂，使子宮內膜反應異常，其組織學變化失去規律性，可以是從增殖期到分泌期的任何一個階段的改變。功能失調性子宮出血者大部分為無排卵性出血，卵泡有某種程度的發育并持續存在，但不能排卵也無黃體形成，長期受雌激素作用的子宮內膜以破綻出血或消退出血的形式出血，量的多少，持續時間長短都不確定。排卵期出血，排卵前由于雌激素水平的低落，在排卵期可見少量陰道出血。月經前出血是由于黃體功能不全，雌激素、孕激素分泌不足引起的。月經后出血由于黃體退行緩慢、孕激素持續分泌造成的。子宮內膜增殖癥所引起的出血由于卵泡持續存在并分泌一定量的雌激素致使子宮內膜異常增殖，子宮內膜多呈腺囊性增生過長。子宮內膜成熟不全所致的出血，是由于雌激素、孕激素分泌失衡所引起的。
