2012年8月15日，中華網報道了《合生元金裝奶粉存蟲子和異物吃壞孩子腸胃》。報道顯示，網友“現在的生活是飄啊飄的”近日在微博上投訴， “我的小孩9個月了，一直吃合生元超級金裝奶粉，最近有買了一個2階段的，奶粉較以前的發白，溶解較差，小孩吃了之后一天拉三四次肚子，請生元公司給予合說明。”
對此，合生元官方微博給網友回復稱，“每個品牌奶粉的生產過程和條件或添加的成分都不盡相同，甚至同一品牌冬季及夏季泌乳在味道及顏色上都有些許的差異這些都是讓奶粉質地看起來不一樣的原因。寶寶大便次數增多可能因素較多。”
2012年8月8日，親貝網發表了《合生元二段內發現有蟲子奶粉安全遭網友質疑》。近日，一位名為“不喜歡忽悠的人”的網友在微博上稱，“合生元奶粉2段一打開居然有個小蟲子”。并且，還對國內奶粉的安全提出質疑，稱“現在的寶寶到底還能吃什么奶粉”。
據親貝網統計，這已是合生元近期內第三次被曝出質量問題了。此前，還有消費者投訴稱，在合生元奶粉中發現了類似蟑螂屎的異物和白色的硬物。
2012年8月1日，中國日報網報道了《合生元二段奶粉吃出異物其洋身份遭網友質疑》。報道顯示，近日，網友“Lucas逸洋”在微博上稱， “在合生元超級金裝第二段奶粉中發現了一塊東西，好像是結片的奶，很硬。
有點擔心這奶粉的質量了?大家有發現過這樣的問題嗎?”對此，有網友回復稱，“假洋牌子的奶粉，別害娃，換了吧。法國證實合生元沒有在法國注冊的，有一朋友還在奶粉里面發現過蟲子。”
面對網友的質疑，合生元的官方微博回應稱，“合生元奶粉系列均為歐洲原裝進口，每批產品均具原產地證明和出入境檢驗檢疫衛生證書，保證產品質量和來源。”并且，建議當事網友私信提供聯系方式，表示會有專人跟其聯系。
2012年6月20日，中國網絡電視臺報道了《合生元奶粉現不明膠狀物體廠家：那是蛋白質》。報道顯示，兩個星期前，彭先生在樂清市翁揚接到購買了一盒合生元金裝媽媽配方奶粉，回家沖泡的時候在杯子里發現一團一元硬幣大小的膠狀物體，彭先生告訴記者：“泡開了以后特別惡心，向鼻涕一樣，這團東西風干以后就變成兩顆硬硬的東西，顏色和奶粉差不多，混在奶粉里真不容易察覺。”
事后彭先生聯系了合生元廠家，“廠家說奶粉完全沒有質量問題，出現膠狀是因為蛋白質在運輸途中發生變化，專業術語我也沒聽明白。”彭先生表示對廠家的敷衍解釋非常不滿。
隨后記者撥打了合生元的官方電話反映了彭先生的情況，一位自稱是公共事務部的馮小姐表示要先和消費者取得聯系看到照片才能做出回應，“合生元是一個負責任的企業，我們會馬上聯系消費者盡快處理好此事的。”但是事情過去了多天，彭先生告訴記者合生元方面聯系他拿走照片以后再無回應。
2012年6月5日，青島新聞網發表了《合生元奶粉中現菜葉網友稱曾喝出過金屬》。文章顯示，2012年3月3日，李女士稱自己在臺東利群超市購買了多桶合生元超級金裝較大嬰兒奶粉及兒童益生菌，奶粉每桶價值300多元，消費總計2000多元。
